Stanford Üniversitesi'de okurken kopya çektiği gerekçesiyle okuldan atılmıştır. Ama gerçekten kopya çekmemiştir.Bryce Larkin onun CIA'e katılmaması için bunu yapmıştır. Buy More'da çalışmaktadır. Stanford Üniversitesi'nden atılmasına sebep olan Bryce Larkin adlı bir arkadaşından yıllar sonra gizemli bir e-posta alır. Daha sonra Bryce'tan gelen bir maille hayatı birden değişir. Bryce Larkin CIA'de çalışmaktadır ve gizli devlet sırlarını ele geçirir. Bu sırları içeren binlerce resimden oluşan elektronik postayı öldürülmeden önce Chuck'a gönderir. Birleşik Devletler'in en gizli sırları Chuck'ın zihnine kaydedilir. Chuck'ı korumak için iki ajan gönderilir: Ajan Sarah Walker (CIA) ve ajan John Casey (NSA). Asıl olaylar bundan sonra başlar. Üstüne üstlük bir de Chuck Sarah Walker'a sırılsıklam aşık olunca işler daha beter sarpa sarar. Aynı zamanda Ablası Ellie Bartowski'dir ve anne-babaları küçük yaşta onları tekretmiştir. (Önce anne sonra baba)
Bu nedenle annelerinin onları terkettiği gün olan Anneler gününü hayatta ayaklarının üstünde durabilme günü olarak kutlarlar.
2. sezonda babasının bu operasyonu başlatan kişi olduğunu öğrenir.Bu yüzden CIA İntersect fikrinden vazgeçer ama sonra Fulcrum yeni ve kendine ait bir İntersect kurmak için babasını Kaçırır Ve 21. bölümde Chuck ve ekibi tarafından babası kurtarılır ve İntersect Chuck'tan silinir aynı zamanda 2. intersect yok edilir.Sezon finalinde Bryce Larkin Yeni İntersecti Kullanmaya Giderken Fulcrum'un Bir üst Örgütü tarafından vurulur ve kendisini İntersect'in odasına kilitler. Bunu anlayan Chuck ve ekibi çatışmaya girer. Chuck havalandırmadan içeri girer ve Bryce'dan görevi devralır. Ardından İntersect'i yeniden kendisine yükler. Yeni İntersect sayesinde süper ajana dönüşür, dövüşme ve silah becerisi kazanır.6 Ring(Fulcrumun Bir üst Örgütü) ajanını dövüşerek öldürür. 3.Sezonda ise Chuck yeni yetenekleriyle karşımızda olacaktır,izlenen trailerlara bakıldığında Chuck yer yer Kung Fu yapacak,süper gitar çalacak hatta Çince bile konuşacaktır.Çok iyi silah kullanıp doktorluk yapabilecek aynı zamanda boks tekniklerinin hepsini öğrenip Casey'i dövecektir.
3. sezonun son bölümlerinde Chuck rüyalarında intersectin çalışıp Daniel Shaw'un canlı olduğunu göstermektedir ancak CIA psikoloğu Chuck`ın akli dengesinin Intersect tarafından bozulduğunu söyler ama Chuck bunu Sarah`ya söylemez Chuck artık ne zaman bir şeye çaksa beyni daha da kötüleşmektedir Babasının yaptığı "PATRON" adında bir alet bu dalgalanmaları önler ancak RING de PATRON`un peşindedir Daniel Shaw Chuck`ın babasını öldürür ve PATRON`u ele geçirir Chuck bir şekilde Daniel Shaw`u yener ve Patron`u geri alır ancak gece babasının şerefine kadeh kaldırırken telefonuna bir mesaj gelir "Bilgisayarına git" ve gittiği zaman babasının yolladığı bir maili açar ve annesinin yaşadığını öğrenir.